המצווה שהכי מזוהה עם הבר מצווה, זאת בלי ספק מצוות התפילין. בגלל קדושת התפילין אין נותנים לקטן שלא מספיק בוגר לשמור את גופו נקי להניח תפילין אלא מחכים קרוב לגיל 13.

מצווה זאת היא גם סימן מובהק להמשך השושלת מאברהם יצחק ויעקב עד הסבא האבא והבן. ועל מנת להמחיש לנער את חשיבות התפילין אין דבר יותר טוב, מלהיות איתו ביחד בשעת הכנסת הפרשיות לתפילין, ככה הוא גם רואה בדיוק מה הוא מניח. וגם לומד דברים חשובים ומעניינים על התפילין, ובכך הוא יכול להרגיש חיבור עצום למצוות התפילין.